হাটখোলা উচ্চ বিদ্যালয়টি ২০০১ সালে প্রথমে হাটখোলা প্রাথমিক বিদ্যালয় হিসেবে প্রতিষ্ঠিত হয়। প্রতিষ্ঠাতা সভাপতি ছিলেন মরহুম জনাব আলহাজ্ব নজরুল ইসলাম সাহেব। পরবর্তিতে ২০০২ খ্রিঃ থেকে হাটখোলা জুনিয়র হাই স্কুল হিসেবে স্বীকৃতি পায়। অতপর ২০১৬ সাল থেকে হাটখোলা উচ্চ বিদ্যালয় হিসেবে স্বীকৃতি লাভ করে। অদ্যবধি হাটখোলা উচ্চ বিদ্যালয় হিসেবে বর্তমানে পরিচিতি লাভ করেছে।